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Bio++, développement C++ pour libérer l'enseignement et la recherche en génétique et bio-informatique


L'enseignement et la recherche en génétique et en bio-informatique, en milieu universitaire comme en école d'ingénieur, requiert l'usage de logiciels scientifiques spécifiques et sophistiqués. Or l'enseignant, l'étudiant et le chercheur voudraient être libres d'exercer leur activité comme ils l'entendent et sans avoir de comptes à rendre à des entreprises commerciales ou à des gouvernements étrangers. Par exemple, doit-on priver un enseignant du meilleur moyen de partager sa connaissance sous prétexte que son établissement, dans un pays en développement, ne verse pas assez d'argent à une entreprise ? Doit-on priver un étudiant de ses meilleures chances de réussite dans son apprentissage des sciences ? Peut-on l'accuser de contre-façon et le priver de sa liberté d'étudier un algorithme de calcul pour la génétique ou un logiciel de bio-informatique ?

Pour que tous aient accès à la connaissance, certaines libertés des enseignants, de leurs étudiants et des chercheurs doivent être garanties. C'est pourquoi l'enseignant qui créé ou utilise un logiciel libre tel que Bio++ est et restera libre d'utiliser gratuitement, d'étudier, d'améliorer voire même de redistribuer son logiciel scientifique.


Compétence nécessaire : Développement C++
Connaissances souhaitables : Notions de génétique et de bioinformatique

Bio++ est un ensemble de bibliothèques C++ pour bioinformatique, comprenant analyse de séquences, phylogénétique, évolution moléculaire et et génétique des populations. Programmes associés : ConTest (Contstraint Testing) et CoMap (C++ shell program to detect co-evolving groups of sites). Plus d'infos sur : - https://gna.org/projects/bppsuite - http://home.gna.org/bppsuite/ - http://kimura.univ-montp2.fr/BioPP/

Contribuer au développement, à la documentation et à la maintenance

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